1、黄腐酸可以在土壤中形成胶状物质，将土壤颗粒胶结起来，从而增加土壤中的水稳性团粒，促进团粒结构形成，同时还可以疏松土壤，提高土壤的保水保肥能力。
2、黄腐酸是一种弱酸，与钾、钠、铵等一价阳离子可以形成溶于水的弱酸盐类，组成缓冲溶液，从而当外界酸性或碱性物质进入土壤之中时，能够在一定程度上维持土壤原ph，保持大致不变，为作物提供一个稳定的生长环境。
3、黄腐酸是氮肥的缓释剂和稳定剂，磷肥的增效剂，钾肥的保护剂（对于氮元素，黄腐酸可以减少氮素挥发，促进氮的吸收，同时加快有机氮矿化速度，提高土壤速效氮含量。对于磷元素，黄腐酸可以降低土壤对于速效磷的固定作用，让土壤中的难溶性磷转化为有效磷，同时增加磷元素在土壤中的移动距离。对于钾元素，黄腐酸可以减少土壤对于钾的吸收固定，同时促进难溶性钾的释放，增加速效钾含量）。使用之后，可以增加土壤养分含量，减少土壤养分流失，促进作物吸收养分，提高肥效，同时还能增强作物的抗寒、抗旱、抗盐碱能力。
4、黄腐酸含有多种官能团，可以刺激作物的生长发育以及生理代谢。主要表现为：促进种子萌发，刺激根部生长发育，促进根部呼吸，增强根系活力，从而增强作物对于养分的吸收能力，同时还可以促进叶绿素形成以及植物中糖和氨基酸的形成，从而增强作物的光合作用和呼吸作用强度。
5、黄腐酸可以和汞、砷、镉、铬、铅等重金属形成难溶性物质，从而降低重金属对于作物的危害。
