小鲤鱼历险记》讲述了一条名叫泡泡的平凡小鲤鱼，在他的家乡被癞皮蛇毁灭后，历尽了世间的艰险与磨难，锻炼出优秀品格，终于依靠自己坚定不移的信念，在小伙伴阿酷、小美美、双面龟等的帮助下，聚齐了五行龙鳞，最终飞跃龙门战胜了恶魔癞皮蛇，拯救鲤鱼湖、恢复了美好的家园，创造出不平凡业绩的故事。故事里面也有真善美假恶丑，但不再是从前那种导演与动画角色坐在玻璃盒子中对观众来进行直白说教，而是能真正将自己代入情节，自动地去对一些事情进行思考。
从爱撒娇变成有坚定品质的男子汉的小鲤鱼泡泡，个性骄傲却心地善良的魔术师海马阿酷，温柔善解人意的歌手水母小美美，还有唠叨的受欺负的双面龟，大家在朋友们的帮助下勇敢地同强大的敌人战斗，最终获得胜利。
